宏基因组二代测序（metagenomic next-generation sequencing，mNGS）作为一种新型病原检测方法，检测范围广泛，可检测细菌、病毒、真菌、寄生虫、罕见病原体、甚至未知病原体。mNGS 具有无偏倚性，可以快速、高效、准确获得检测样本中所有核酸信息，分析出致病病原体，指导临床诊断和治疗，在疑难感染性疾病中发挥着重要作用。

但是在 mNGS 检测过程中经常会出现假阳性的问题，原因可能是实验室试剂、离心管中普遍存在微量 DNA 污染物或其他实验流程步骤中引起的 DNA 污染。为了满足客户 mNGS 测序样本前处理过程中消除背景菌污染问题，为度生物可提供无背景微生物污染的高品质核酸提取磁珠及相关的解决方案，有效解决磁珠背景微生物污染问题，避免结果判读，提升 mNGS 检测结果准确性。
 

为度生物去除磁珠背景菌污染方案展示

（以MA0308C 磁珠为例）
 

检测方法：使用 16s rDNA 扩增试剂盒检测背景菌去除和未去除的磁珠的保存液，以确认磁珠原液中背景菌残留的情况。

结论：经过背景菌去除处理的磁珠，保存液 CT 值与阴性水的 CT 值接近，与磁珠处理前结果相比，有非常明显的改善。


方法：20μL 经过处理和未处理的磁珠，分别提取 HBV、HCV 病毒核酸并进行扩增检测。

结论：处理后的磁珠与未经过处理的磁珠，HBV 和 HCV 检测结果显示合格，说明经过处理的磁珠本身不受影响，性能稳定。


方法：将磁珠进行30天、45℃加速老化，使用16s rDNA扩增试剂盒检测背景菌去除和未去除的磁珠保存液，以确认磁珠原液中背景菌残留的情况。

结论：经过背景菌去除处理的磁珠在 30 天加速老化后，磁珠保存液 CT 值与阴性水 CT 值接近，说明背景菌去除彻底。


方法：20μL 经过处理和未处理的磁珠，分别提取 HBV、HCV 病毒核酸并进行扩增检测。

结论：经过处理后的磁珠与对照磁珠 CT 值基本一致，说明经过 30 天加速老化的背景菌去除磁珠，核酸捕获效率与对照磁珠一致，磁珠性能无变化。

 

经以上实验测试结果可得：经过处理后的磁珠，可有效去除磁珠背景微生物污染，且对磁珠无影响，核酸捕获性能稳定。


参考文献：

1. 宏基因组二代测序在疑难感染性疾病中的临床应用价值

2. Chen P, Sun W, He Y. Comparison of metagenomic next-generation sequencing technology, culture and GeneXpert MTB/RIF assay in the diagnosis of tuberculosis[J]. Journal of Thoracic Disease, 2020, 12(8): 4014.