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测序专栏--测序产物纯化与片段筛选
人阅读 发布时间:2018-11-29 11:25
高通量测序技术(High-throughput sequencing)又称“下一代”测序技术("Next-generation" sequencing technology),一次能对几十万到几百万条 DNA 分子进行序列测序,使得对一个物种的转录组测序或基因组深度测序变得方便易行。第二代基因测序技术目前已经成为市场商用主流。三代测序将是未来的大势所趋,但是预计在将来 5-10 年内二、三代基因测序会共存,但二代测序仍将是测序市场商业应用主流。
基因测序技术正在越发深刻地影响着疾病预防诊疗等领域的发展,高通量测序技术在临床诊断中的主要应用:
出生缺陷相关分子诊断中的应用:
• 无创产前检测领域中的应用(NIPT)
• 染色体畸变检测领域中的应用(CNV-seq)
• 胚胎植入前遗传学筛查领域中的应用(PGS)
肿瘤相关分子诊断中的应用:
• 遗传性肿瘤突变检测(Germ line)
• 肿瘤组织体细胞突变检测(Somatic)
• 液态活检(Liquid Biopsy)
基因检测,是“精准”发现和诊断的基础,基因检测样本的处理关系着检测结果的可靠性和稳定性,起着非常关键的作用。因此,用于样本处理的试剂,如酶、引物、建库试剂盒、产物纯化与片段筛选试剂盒等的质量均决定着测序结果的准确性,必须引起重视。
CleanNGS-高通量测序产物纯化与片段筛选磁性微球,源自欧洲实力品牌 CLEANNA,特点如下:
产品应用及结果展示:
一、DNA/RNA 纯化
二、片段筛选
核酸片段的两侧筛选结果展示
0.8x/0.7x (左侧/右侧):CleanNGS 的加入量与样本量的比率,样本量 50 ul。
目的片段筛选结果展示(使用 Agilent TapeStation 2200 进行分析)
0.8x/0.7x (左侧/右侧):CleanNGS 的加入量与样本量的比率,样本量25 ul。
文库质量(使用 BioAnalyzer 2100 进行分析)
针对 300bp 以上(含300bp)核酸片段进行筛选,与竞品相比,CleanNGS 获得的目的片段量更多,纯度更高。
苏州为度生物技术有限公司
电话:0512-80905220
传真:0512-80905230
邮箱:vdo@vdobiotech.com
网址:www.vdobiotech.com
邮编:215123
地址:苏州市星湖街218号生物纳米园C29幢5楼
基因测序技术正在越发深刻地影响着疾病预防诊疗等领域的发展,高通量测序技术在临床诊断中的主要应用:
出生缺陷相关分子诊断中的应用:
• 无创产前检测领域中的应用(NIPT)
• 染色体畸变检测领域中的应用(CNV-seq)
• 胚胎植入前遗传学筛查领域中的应用(PGS)
肿瘤相关分子诊断中的应用:
• 遗传性肿瘤突变检测(Germ line)
• 肿瘤组织体细胞突变检测(Somatic)
• 液态活检(Liquid Biopsy)
基因检测,是“精准”发现和诊断的基础,基因检测样本的处理关系着检测结果的可靠性和稳定性,起着非常关键的作用。因此,用于样本处理的试剂,如酶、引物、建库试剂盒、产物纯化与片段筛选试剂盒等的质量均决定着测序结果的准确性,必须引起重视。
CleanNGS-高通量测序产物纯化与片段筛选磁性微球,源自欧洲实力品牌 CLEANNA,特点如下:
产品优势: 1. 微球粒径单分散、表面基团均一、悬浮性好; 2. 与 Agencourt AMPure XP 试剂产品 1:1 替换,操作流程兼容,检测结果一致性好; 3. 无 RNA 酶生产体系,DNA 纯化、RNA 纯化均适用; 4. 配合专用试剂,可有效去除 dNTP、引物、引物二聚体、盐离子和其他杂质; 5. 扩增产物回收率高; 6. 手动操作、自动化工作站操作即可。 |
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产品应用及结果展示:
一、DNA/RNA 纯化
分别用 CleanNGS 与竞品 A,Z 纯化核酸,采用 Nanodrop,Qubit 对纯化后的核酸进行分析;结果显示三种产品均可纯化核酸, 与竞品 A,Z 相比,CleanNGS 捕获的核酸片段量更多。 |
二、片段筛选
核酸片段的两侧筛选结果展示
0.8x/0.7x (左侧/右侧):CleanNGS 的加入量与样本量的比率,样本量 50 ul。
目的片段筛选结果展示(使用 Agilent TapeStation 2200 进行分析)
0.8x/0.7x (左侧/右侧):CleanNGS 的加入量与样本量的比率,样本量25 ul。
文库质量(使用 BioAnalyzer 2100 进行分析)
WB1 | WB2 | WB3 | WB4 | WB5 | WB6 | WB7 | WB8 | |
CleanNGS | 340 pg/μl | 385 pg/μl | 630 pg/μl | 389 pg/μl | 971 pg/μl | 1148 pg/μl | 601 pg/μl | 851 pg/μl |
Comp A | 231 pg/μl | 236 pg/μl | 580 pg/μl | 371 pg/μl | 894 pg/μl | 821 pg/μl | 558 pg/μl | 734 pg/μl |
针对 300bp 以上(含300bp)核酸片段进行筛选,与竞品相比,CleanNGS 获得的目的片段量更多,纯度更高。
苏州为度生物技术有限公司是一家专注于生物技术领域内微球产品规模化生产与应用的高新技术企业。产品主要有乳胶微球、彩色微球、磁性微球、荧光微球、流式微球、标准微球等全系列微球产品,产品粒径均一可控,多种功能指标可进行定制性调节,目前已经开发出应用于体外诊断试剂的多种系列产品,并在其他应用方向上展开多项技术开发。此外,我们也可以为客户提供微球及其应用产品的定制和 OEM 服务,同时我们也将为实现客户良好的产品应用体验提供深度的技术解决方案。公司位于苏州工业园区生物纳米园,拥有场地 1500 平米,其中近 1000 平米的净化区域用于研发实验室和生产车间。我们将不断创新微球制备与应用技术,面向全球市场,锐意进取! |
苏州为度生物技术有限公司
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传真:0512-80905230
邮箱:vdo@vdobiotech.com
网址:www.vdobiotech.com
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地址:苏州市星湖街218号生物纳米园C29幢5楼